东吴作业区连片开发建设东1#、东2#、4#、5#、6#等5个深水码头泊位。目前建成投产东1#、东2#泊位，最大靠泊20万吨级船，日卸船能力为4万吨以上，主要从事煤炭、矿石等散货装卸、堆存、混配等业务;主要经营港口开发、货物装卸、仓储、中转、物流服务等。东1#、东2#泊位后方陆域面积达93万平米，堆场面积为70万平米，静态堆存420万吨煤炭（铁矿石560万吨）；4#、5#、6#泊位后方形成陆域面积达58万平米，设计堆场面积为27万平米，可一次性堆存170多万吨煤炭（铁矿石210多万吨）。向莆铁路通过疏港铁路东吴支线到达东吴作业区，已形成直通全程国铁的港铁联运。